it-swarm.com.ru

установка Mayavi с помощью pip - нет модуля с именем vtk

Я хочу использовать Mayavi.

Ситуация

  • Я использую MacBook Air с OSX 10.7.3.
  • Я использую Python 2.7.2
  • Я установил virtualenv. Но я не использовал его для этой установки.

Я вручную установил все его зависимости, включая VTK.

Для VTK я следовал его руководству по установке и установил оболочку Python.

Теперь, если я открою новое окно терминала и открою python, я могу импортировать vtk без каких-либо ошибок.

Проблема

Я пытаюсь установить Mayavi с помощью следующей команды:

pip install mayavi

Но возникает следующая ошибка:

Downloading/unpacking mayavi
  Running setup.py Egg_info for package mayavi
    build_src
    building extension "tvtk.array_ext" sources
    building data_files sources
    build_src: building npy-pkg config files

    no previously-included directories found matching 'artwork'
    no previously-included directories found matching 'docs/pdf'
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): apptools in /Library/Python/2.7/site-packages (from mayavi)
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): traits in /Library/Python/2.7/site-packages (from mayavi)
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): traitsui in /Library/Python/2.7/site-packages (from mayavi)
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): configobj in /Library/Python/2.7/site-packages (from apptools->mayavi)
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): pyface in /Library/Python/2.7/site-packages (from traitsui->mayavi)
Installing collected packages: mayavi
  Running setup.py install for mayavi
    Traceback (most recent call last):
      File "<string>", line 1, in <module>
      File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 498, in <module>
        **config
      File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.Egg/numpy/distutils/core.py", line 186, in setup
        return old_setup(**new_attr)
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/core.py", line 152, in setup
        dist.run_commands()
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 953, in run_commands
        self.run_command(cmd)
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command
        cmd_obj.run()
      File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.Egg/numpy/distutils/command/install.py", line 57, in run
        r = self.setuptools_run()
      File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.Egg/numpy/distutils/command/install.py", line 31, in setuptools_run
        return old_install_mod._install.run(self)
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/command/install.py", line 573, in run
        self.run_command('build')
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/cmd.py", line 326, in run_command
        self.distribution.run_command(command)
      File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command
        cmd_obj.run()
      File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 303, in run
        build_tvtk_classes_Zip()
      File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 290, in build_tvtk_classes_Zip
        gen_tvtk_classes_Zip()
      File "tvtk/setup.py", line 46, in gen_tvtk_classes_Zip
        from code_gen import TVTKGenerator
      File "tvtk/code_gen.py", line 10, in <module>
        import vtk
    ImportError: No module named vtk
    Complete output from command /usr/bin/python -c "import setuptools;__file__='/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py';exec(compile(open(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --single-version-externally-managed --record /var/folders/53/_trhc_0x0fb6kvx6bw_wrk500000gn/T/pip-Z4hpsW-record/install-record.txt:
    running install

running build

Traceback (most recent call last):

  File "<string>", line 1, in <module>

  File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 498, in <module>

    **config

  File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.Egg/numpy/distutils/core.py", line 186, in setup

    return old_setup(**new_attr)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/core.py", line 152, in setup

    dist.run_commands()

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 953, in run_commands

    self.run_command(cmd)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command

    cmd_obj.run()

  File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.Egg/numpy/distutils/command/install.py", line 57, in run

    r = self.setuptools_run()

  File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.6.1-py2.7-macosx-10.7-intel.Egg/numpy/distutils/command/install.py", line 31, in setuptools_run

    return old_install_mod._install.run(self)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/command/install.py", line 573, in run

    self.run_command('build')

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/cmd.py", line 326, in run_command

    self.distribution.run_command(command)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command

    cmd_obj.run()

  File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 303, in run

    build_tvtk_classes_Zip()

  File "/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py", line 290, in build_tvtk_classes_Zip

    gen_tvtk_classes_Zip()

  File "tvtk/setup.py", line 46, in gen_tvtk_classes_Zip

    from code_gen import TVTKGenerator

  File "tvtk/code_gen.py", line 10, in <module>

    import vtk

ImportError: No module named vtk

----------------------------------------
Command /usr/bin/python -c "import setuptools;__file__='/Users/Yasser/build/mayavi/setup.py';exec(compile(open(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --single-version-externally-managed --record /var/folders/53/_trhc_0x0fb6kvx6bw_wrk500000gn/T/pip-Z4hpsW-record/install-record.txt failed with error code 1 in /Users/Yasser/build/mayavi
Storing complete log in /Users/Yasser/Library/Logs/pip.log
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/pip", line 8, in <module>
    load_entry_point('pip==1.1', 'console_scripts', 'pip')()
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/pip-1.1-py2.7.Egg/pip/__init__.py", line 116, in main
    return command.main(args[1:], options)
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/pip-1.1-py2.7.Egg/pip/basecommand.py", line 141, in main
    log_fp = open_logfile(log_fn, 'w')
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/pip-1.1-py2.7.Egg/pip/basecommand.py", line 168, in open_logfile
    log_fp = open(filename, mode)
IOError: [Errno 13] Permission denied: '/Users/Yasser/Library/Logs/pip.log'

Я думаю, что проблема с vtk.

Может кто-нибудь мне помочь?

Другие детали

Запуск Sudo pip install mayavi не решает проблему.

Я думал, что это может помочь

› which python
/usr/local/bin/python

› python
Python 2.7.2 (default, Feb 17 2012, 13:57:55) 
[GCC 4.2.1 (Based on Apple Inc. build 5658) (LLVM build 2335.15.00)] on darwin
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import vtk
>>> vtk
<module 'vtk' from '/usr/local/Cellar/python/2.7.2/lib/python2.7/site-packages/VTK-5.10.0-py2.7.Egg/vtk/__init__.pyc'>
>>> 

Мой PYTHONPATH пуст.

29
Yasser Souri

Ваш pip, вероятно, использует другой python, у вас vtk установлен с использованием /usr/local/bin/python, а ваш pip использует /usr/bin/python.

Проверь это:

$ head -n1 $(which pip)

Чтобы решить эту проблему, вы можете использовать virtualenv или установить pip, используя /usr/local/bin/python:

curl https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py | /usr/local/bin/python

Для получения дополнительных инструкций по установке см. http://www.pip-installer.org/en/latest/install.html

10
Hugo Tavares

Я нахожусь на Debian, но это должно работать и для вас

Я застрял с установкой vtk в virtualenv, после нескольких часов поиска без результатов я сделал следующее, и это сработало.

  1. установить python-vtk из репозиториев всей системы

  2. скопируйте папку vtk из /usr/lib/pymodules/python2.7 в /PATH/TO/YOUR/VIRTUALENV/lib/python2.7/site-packages

В вашем случае общесистемная папка пакетов python, вероятно, будет другой, но вы можете легко найти ее, запустив системный python и введя следующее:

import vtk,sys
print(sys.modules['vtk'])

После этого трюка Mayavi был успешно установлен в моем virtualenv с помощью pip install mayavi и pip install. 

Правка: вместо копирования может быть лучше просто символическую ссылку на папку в шаге 2

16
Hennadii Madan

У меня была та же проблема, и первый ответ мне не помог, потому что pip был в правильном каталоге, но оказалось, что у меня не установлен vtk - запуск Sudo apt-get install python-vtk устранил проблему, и я смог чтобы после этого успешно запустить pip install mayavi.

8
Alex

У меня была такая же проблема при установке Mayavi с Python, установленным в Pyenv, и я решил эту проблему, скопировав каталог в /home/myname/.pyenv/versions/2.7.12/lib/python2.7/site-packages, ниже мой метод:

  1. установить vtk и python-vtk

    Sudo apt-get install vtk6
    Sudo apt-get install python-vtk
    
  2. попробуйте python -c "import vtk", если снова не удалось, перейдите к шагу 3

  3. ошибка импорта может быть вызвана потерей папки пакета vtk в вашем текущем питоне, поэтому мы должны найти папку vtk и скопировать в ваш текущий питон (наиболее вероятно, в python в каталоге pyenv shims).

    путь к папке vtk в моем Ubuntu

    /usr/lib/python2.7/dist-packages/vtk
    

    просто скопируйте папку vtk в текущий код питона /site-packages, например, 

    cp -r /usr/lib/python2.7/dist-packages/vtk /home/myname/pyenv/versions/2.7.12/lib/python2.7/site-packages
    
  4. попробуйте python -c "import vtk" снова.

  5. если нет ошибки импорта, просто сделайте

    pip install mayavi
    
3
PytLab

Я несколько раз настаивал на установке Sudo, наконец-то решил, не знаю, как объяснить.

Sudo python2 -m pip install mayavi

Sudo python3 -m pip install mayavi
1
Paul Chen